衛生福利部今年仍然指定「醫療財團法人台灣血液基金會」配合辦理「新冠病毒血清抗體監視系統」作業，並依據「傳染病防治法」第26條及「傳染病流行疫情監視及預警系統實施辦法」第3條及第6條指定為依法執行的公務作業，以利常規監測執行，且檢體是透過隨機抽樣取得與處理，無從識別特定捐血人，但也會主動告知有受抽樣的捐血人可選擇退出。
我國疫情雖然趨緩，但COVID-19在社區流行情形及變化仍須常態性以多元方式監測，因此血清抗體監視系統就是重要的監測項目之一，指揮中心發言人羅一鈞表示，今年不同於去年、前年以新興傳染病研究計畫經人體研究倫理審查會審查通過方式，今年度為依法執行。血液基金會針對今年1到6月期間捐血者的血液留樣檢體隨機抽樣約7,000件，並將無從識別特定捐血人資料與0.5c.c.血液檢體，提供疾管署檢測新冠病毒抗體與分析資料。
發言人羅一鈞也澄清，今年一樣有選擇退出的機制，來兼顧民眾的自主權與捐血的實務作業，民眾如不願意提供檢體給該監視系統利用，得於收到血液基金會信件通知後2週內，致電疾管署1922或0800-001922防疫專線，提供「血袋號碼」或「姓名、身分證字號及生日」資料，疾管署將以加密的電子郵件轉知血液基金會排除抽樣檢體，疾管署便立即刪除該筆紀錄，不會留作其他用途，截至今日共有24位民眾選擇退出。
指揮中心表示，這項計畫是以監視系統來瞭解我國社區中COVID-19感染情形與變動趨勢，因此指定血液基金會配合辦理，而疾管署於檢體收件後僅檢驗自然感染新冠病毒產生的抗N抗體，不會進行其他檢驗，檢驗後的剩餘檢體亦將由疾管署依感染性廢棄物處理銷毀，因此血液基金會與疾管署均無法自檢體辨識特定捐血人，亦無法通知其檢驗結果及進行防治，但統計分析結果將適時公布，以作為制定我國COVID-19防治政策的重要依據。